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1.
Respirar (Ciudad Autón. B. Aires) ; 15(3): [168-175], sept. 2023.
Article in Spanish | LILACS, UNISALUD, BINACIS | ID: biblio-1510524

ABSTRACT

Introducción: la micobacteria no terberculosa (NTM) forma un grupo heterogéneo de microorganismos que pueden causar infección en humanos. Las micobacterias no pigmentadas de rápido crecimiento (MNPCR) son de interés clínico debido al creciente número de pacientes infectados por ellos y a la dificultad del tratamiento. Dentro de este grupo, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium abscessus y Mycobacterium chelonae son reconocidos como patógenos potenciales; estas especies se han aislado de infecciones pulmonares y extrapulmonares. Objetivo: el objetivo de este trabajo es encontrar la frecuencia de aislamiento de especies micobacterianas de rápido crecimiento, específicamente el complejo Mycobacterium fortuitum, de muestras clínicas utilizando la técnica molecular de diagnóstico GenoType Mycobacterium CM. Material y Método: se analizaron 249 aislados de micobacterias no tuberculosas obtenidas de muestras pulmonares y extrapulmonares de pacientes sintomáticos en el período enero 2018-diciembre de 2022. La técnica molecular GenoType Mycobacterium CM se utilizó para identificar la especie. Resultados: Se obtuvieron 77 (3,9%) aislados de especies no pigmentadas de rápido crecimiento, estas se identificaron en orden decreciente: Mycobacterium fortuitum 65 (84,41%), Mycobacterium abcessus 9 (11,68%) y Mycobacterium chelonae 3 (4%). Conclusiones: los resultados reafirman que el complejo Mycobacterium fortuitum es responsable de la mayoría de las infecciones causadas por la micobacteria en rápido crecimiento en humanos. La técnica diagnóstica GenoType Mycobacterium CM es una herramienta útil para la rápida identificación de micobacterias; proporciona resultados precisos en menos tiempo, acortando significativamente el tiempo diagnóstico, permite la aplicación temprana de tratamiento específico, evitando así la propagación de la infección.


Introduction: non-tuberculous mycobacteria (NTM) form a heterogeneous group of mi-croorganisms that can cause infection in humans. Fast-growing non-pigmented my-cobacteria (MNPCR) are of clinical interest due to the increasing number of patients infected by them and the difficulty of treatment. Within this group, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium abscessus and Mycobacterium chelonae are recognized as potential pathogens; these species have been isolated from both pulmonary and ex-trapulmonary infections. Objective: the objective of this work is to find the frequency of isolation of fast-growing non-pigmented mycobacterial species, specifically the Myco-bacterium fortuitum complex, from clinical samples using the GenoType® Mycobacteri-um CM diagnostic molecular technique. Material and Method: 249 isolates of non-tu-berculous mycobacteria obtained from pulmonary and extrapulmonary samples from symptomatic patients in the period January 2018-December 2022 were analyzed. The G e n oTy p e® Mycobacterium CM molecular technique was used to identify the species. Results: 77 (30.9%) isolates of fast-growing non-pigmented species were obtained, these were identified in decreasing order: Mycobacterium fortuitum 65 (84.41%), Myco-bacterium abcessus 9 (11.68%) and Mycobacterium chelonae 3 (4%). Conclusions: the results reaffirm that the Mycobacterium fortuitum complex is responsible for most in-fections caused by fast-growing mycobacteria in humans. The GenoType® Mycobacte-riumCM diagnostic technique is a useful tool for the rapid identification of mycobacte-ria; it provides accurate results in less time, significantly shortening the diagnostic time, it allows the early application of specific treatment, thus avoiding the spread of infec-tion.


Subject(s)
Humans , Nontuberculous Mycobacteria/isolation & purification , Mycobacterium Infections, Nontuberculous/diagnosis , Therapeutics , Molecular Diagnostic Techniques/methods
2.
Rev. cuba. med. trop ; 74(2): e768, May.-Aug. 2022. graf
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-1408905

ABSTRACT

Introducción: La coinfección del virus de inmunodeficiencia humana (VIH) y la tuberculosis ha alterado su presentación histológica, esto es particularmente frecuente en las linfadenitis. Objetivos: Realizar la caracterización etiológica de linfadenopatías producidas por el género Mycobacterium, destacar la importancia del diagnóstico precoz de esta enfermedad para evitar diseminación de la infección, tanto en pacientes inmunocompetentes como inmunodeficientes, específicamente con VIH/sida. Método: Se realizó estudio descriptivo-prospectivo entre enero de 2017 y enero de 2019. Durante este período se recibieron 5640 muestras, de estas 81 obtenidas a partir de tejido ganglionar; la toma de muestra mayoritariamente fue quirúrgica 74 (91,35 por ciento) y 7 (8,64 por ciento) por biopsia aspirativa (BAAF). Del total de muestras, 60 (74,07 por ciento) procedían de pacientes con VIH/sida, las muestras se descontaminaron por el método de ácido sulfúrico al 4 por ciento, se cultivaron en medio sólido Löwenstein-Jensen e incubaron a 37°C. Se realizaron lecturas semanalmente. Para identificar Mycobacterium tuberculosis se realizó la prueba rápida comercial inmunocromatográfica SD TB AgMPT64. Resultados: De 81 muestras analizadas se obtuvieron 22 (27,16 por ciento) aislamientos, 16 (72,72 por ciento) de Mycobacterium tuberculosis, y 6 (27,27 por ciento) de especies no tuberculosas. De estas, 18 (81,81 por ciento) procedían de pacientes con VIH/sida. Conclusión: Por todo lo antes expuesto es importante la vigilancia diagnóstica en este tipo de infección extrapulmonar, tanto para M. tuberculosis como para otras especies no tuberculosas y poder comenzar tempranamente el tratamiento específico evitando la diseminación de la infección, pues esta puede tener consecuencias fatales, sobre todo en pacientes con algún tipo de inmunosupresión, como aquellos con VHI/sida. Si un paciente mantiene fiebre prolongada, con linfadenopatías, sin síntomas respiratorios y no responde a los tratamientos con antibióticos, es necesario pensar en este tipo de infección(AU)


Introduction: The coinfection of human immunodeficiency virus (HIV) and tuberculosis has altered its histological presentation; this is particularly frequent in lymphadenitis. Objective: To carry out the etiological characterization of lymphadenopathies produced by the genus Mycobacterium, highlighting the importance of early diagnosis of this disease to avoid dissemination of the infection, both in immunocompetent and immunodeficient patients, specifically HIV / AIDS. Methods: A descriptive-prospective study was carried out between January 2017 - January 2019. During this period, 5640 samples were received, of these 81 obtained from lymph node tissue, the sample collection was mostly surgical 74 (91.35 percent) and 7 (8.64 percent) by aspiration biopsy (BAAF). Of the total samples, 60 (74.07 percent) were from HIV / AIDS patients, the samples were decontaminated by the 4 percent sulfuric acid method and cultured in solid Löwenstein-Jensen medium and incubated at 370C, the readings were made weekly. For the identification of Mycobacterium tuberculosis, the commercial SD TB AgMPT64 immunochromatographic rapid test was performed. Results: Of 81 samples analyzed, 22 (27.16 percent) isolates were obtained, 16 (72.72 percent) of Mycobacterium tuberculosis (MTB), and 6 (27.27 percent) of non-tuberculous species, of these 18 (81.81%) were from HIV / AIDS patients. Conclusion: For all the above, diagnostic surveillance is important in this type of extrapulmonary infection, both for M tuberculosis and for other non-tuberculous species and to be able to start specific treatment early, avoiding the spread of the infection, since it can have fatal consequences on all in patients with some type of immunosuppression, such as HIV/AIDS. If a patient maintains a prolonged fever, with lymphadenopathy, without respiratory symptoms and does not respond to antibiotic treatment, it is necessary to consider this type of infection(AU)


Subject(s)
Humans , Early Diagnosis , Lymphadenopathy/diagnosis , Lymphadenitis/diagnosis , Epidemiology, Descriptive , Prospective Studies
3.
Rev. cuba. salud pública ; 47(3)sept. 2021.
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-1409234

ABSTRACT

Introducción: Existen diferentes métodos de descontaminación de muestras pulmonares para el diagnóstico de micobacterias. El Programa Nacional de Control de Tuberculosis recomienda el método de Petroff modificado con solución salina, pero no existen evidencias documentadas que avalen este método. Objetivo: Evaluar el método de Petroff modificado con solución salina para el diagnóstico de micobacterias en el sistema Bact/Alert 3D. Métodos: Se realizó un estudio observacional analítico de pruebas diagnósticas utilizando 100 muestras pulmonares recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias del Instituto Pedro Kourí, abril 2016 enero 2017. La muestra se dividió en 3 alícuotas y se descontaminaron mediante 3 métodos; luego se inocularon en los medios de cultivo sólido y líquido. Se compararon los resultados del cultivo en cuanto: tiempo de detección de crecimiento, tasa de contaminación, por ciento de positividad, además se calcularon indicadores de desempeño. Resultados: Al comparar el método Petroff modificado con solución salina con el Petroff modificado con solución fosfato en Löwenstein Jensen, el tiempo de detección de crecimiento, por ciento de positividad y la tasa de contaminación se comportaron de forma similar y la sensibilidad (93,75 por ciento), concordancia (96,47 por ciento) e índice de Youden (0,91) fueron elevadas. Al compararlo el Petroff modificado con solución salina con el N-Acetil-L-Cisteína, las variables no mostraron diferencias significativas y los Indicadores de Desempeño se comportaron por encima del 93 por ciento, para el medio sólido y líquido. Conclusiones: Los resultados avalan la continuidad del uso del Petroff modificado con solución salina como método de descontaminación de las muestras pulmonares en la red de laboratorios de Cuba y como alternativa en el pretratamiento de las muestras para el medio líquido (Bact/Alert 3D), además constituye un soporte para el Programa Nacional de Control de Tuberculosis(AU)


Introduction: There are different decontamination methods of pulmonary samples for the diagnosis of mycobacteria. The National Program for the Control of Tuberculosis recommends Petroff method modified with saline solution; but there are not documented evidences that endorse it. Objective: Assess Petroff method modified with saline solution for the diagnosis of mycobacteria in Bact / Alert 3D system. Methods: An observational analytic study of diagnostic tests was conducted; there were used 100 pulmonary samples received in the National Laboratory of References and Researches of Tuberculosis, Leprosy and Mycobacteria of Pedro Kourí Institute, from April 2016 to January 2017. The sample was divided in 3 aliquots and those were decontaminated using 3 methods; then, they were inoculated in the solid and liquid culture means. Cultures´ results were compared according to: growth's detection time, contamination rate, percent of positivity; in addition, performance indicators were calculated. Results: When comparing Petroff method modified with saline solution with Petroff method modified with phosphate solution in Löwenstein Jensen, the growth's detection time, the percent of positivity and the rate of contamination behaved similarly, and sensitivity (93,75percent), concordance (96,47percent) and Youden´s index (0,91) were high. When the Petroff method modified with saline solution was compared with N-Acetil-L- Cisteina, the variables did not show significative differences and the behaviour indicators were over 93percent for the solid and liquid mean. Conclusions: The results endorse the continuity of the use of Petroff method modified with saline solution as a decontamination method of pulmonary samples in the network of Cuban laboratories and as alternative to the pre-treatment of the samples for the liquid mean (Bact/Alert 3D); it also constitutes a support for the National Program for the Control of Tuberculosis(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , Acetylcysteine , Tuberculosis, Pulmonary/prevention & control , Decontamination/methods , Observational Study
4.
Salud(i)ciencia (Impresa) ; 24(1/2): 12-18, jun. 2020. graf.
Article in Spanish | BINACIS, LILACS | ID: biblio-1129948

ABSTRACT

El aumento de las infecciones por micobacterias ambientales u oportunistas (MAO) coincide mundialmente con el declive de la infección tuberculosa e incremento de la infección por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH). El presente trabajo es un estudio retrospectivo realizado en el Laboratorio Nacional de Referencia-Investigaciones de Tuberculosis/Micobacterias/Lepra (LNRI-TB/Lepra/Micobacterias), del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí (IPK), La Habana, Cuba, durante el período enero 2014-diciembre 2018. El objetivo de nuestro estudio fue conocer la variabilidad de especies aisladas para establecer un referente actualizado sobre las infecciones causadas por estas. En este trabajo se clasificaron-identificaron 413 cepas procedentes de pacientes sintomáticos; 162 (39.22%) eran aislamientos de pacientes con VIH/sida atendidos en nuestro Hospital Nacional de Referencia a Atención al paciente VIH/sida (IPK), y el resto (n = 251 [60.77%]), procedentes de pacientes inmunocompetentes, incluyendo aislamientos recibidos de los Centros Provinciales de Higiene, Epidemiología, y Microbiología (CPHEM). Las muestras fueron analizadas con las técnicas convencionales establecidas: las pulmonares fueron descontaminadas por el método de Petroff modificado; las extrapulmonares, por el método del ácido sulfúrico al 4%; el cultivo se realizó en medio de Löwenstein-Jensen modificado. Posteriormente se realizó la clasificación-identificación de especies según el esquema fenotípico-bioquímico establecido. Las especies con mayor porcentaje de aislamiento pertenecieron a los Grupos III y IV, complejo Mycobacterium avium-intracellulare (34.14%) y complejo M. fortuitum (20.82%), respectivamente. Estos resultados permitirán conocer la prevalencia de estas especies en nuestro país, reafirmando la importancia diagnóstica de estos microorganismos para aplicar tratamiento específico, sobre todo en pacientes con factores de riesgo, en quienes es más probable la diseminación de la infección.


The increase in infections by environmental or opportunistic mycobacteria (MAO) coincides worldwide with the decline in tuberculosis infection and an increase in infection by the human immunodeficiency virus (HIV). The present work is a retrospective study carried out at the National Reference Laboratory-Tuberculosis/Mycobacterial/Leprosy Research (LNRI-TB / Leprosy / Mycobacteria), of the Pedro Kourí Institute of Tropical Medicine (IPK), La Habana, Cuba, during the period January 2014-December 2018. The objective of our study was to know the variability of isolated species to establish an updated reference on the infections caused by MAO. In this study, 413 strains from symptomatic patients were classified and identified; 162 (39.22%) were isolates from patients with HIV/AIDS treated at our National Hospital of Reference for Attention to HIV/AIDS patients (IPK), and the remaining (n=251 [60.77%]), from immunocompetent patients, including isolates received from the Provincial Centers of Hygiene, Epidemiology, and Microbiology (CPHEM). The samples were analyzed with the established conventional techniques: the lung samples were decontaminated by the modified Petroff method; the extrapulmonary, by the 4% sulfuric acid method; the culture was carried out in modified Löwenstein-Jensen medium. Subsequently, the classification-identification of species was carried out according to the established phenotypic-biochemical scheme. The species with the highest percentage of isolation belonged to Groups III and IV, Mycobacterium avium-intracellulare complex (34.14%), and M. fortuitum complex (20.82%), respectively. These results will allow us to know the prevalence of these species in our country, emphasizing the diagnostic importance of these microorganisms and thus apply a specific treatment, especially in patients with risk factors, in whom the spread of the infection is more likely


Subject(s)
Tuberculosis , Mycobacterium avium Complex , Risk Factors , Acquired Immunodeficiency Syndrome , HIV , Mycobacterium , Mycobacterium avium
5.
Salud(i)ciencia (Impresa) ; 21(1): 40-44, Nov.2014. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-790940

ABSTRACT

Las infecciones provocadas por micobacterias atípicas, micobacterias no tuberculosas y más recientemente denominadas micobacterias ambientales u oportunistas, en los últimos tiempos desempeñan un papel preponderante en el diagnóstico clínico. Estas especies se relacionan generalmente con estados de inmuno depresión del paciente. En este trabajo se estudiaron 136 cepas aisladas de pacientes con sintomatología específica tanto pulmonar como extrapulmonar, incluidos aquellos infectados por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), éstas fueron estudiadas e identificadas en el Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias, durante el período de enero de 2011 a diciembre de 2012. Es importante destacar que el 72.79% de los aislamientos eran procedentes de pacientes VIH positivos. El total de las cepas aisladas fue analizado según la clasificación establecida por Runyon; los grupos encontrados con mayor frecuencia fueron el III y el IV; por especie, las de mayor porcentaje de aislamiento fueron las del complejo Mycobacterium avium-intracellulare, Mycobacterium malmoense, Mycobacterium fortuitum y Mycobacterium chelonae, respectivamente. Estos estudios son de gran importancia diagnóstica en los laboratorios de micobacteriología, pues de esta forma se puede llegar a conocer cuáles son las especies micobacterianas predominantes en la población,y lograr establecer una vigilancia sobre este tipo de infecciones, particularmente en pacientes inmunodeficientes, los que pueden ser origen de una peligrosa diseminación de la enfermedad...


Subject(s)
Humans , HIV , Opportunistic Infections , Nontuberculous Mycobacteria , Mycobacterium avium Complex , Infections
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